More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3714 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3714  histidine kinase  100 
 
 		 338 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 445 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 465 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 524 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 449 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344841  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 518 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 505 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  34.63 
 
 		 817 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  33.8 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  34.26 
 
 		 471 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.3 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  30.18 
 
 		 463 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.52 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0747  histidine kinase  31.68 
 
 		 471 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 517 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 449 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 458 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  33.22 
 
 		 454 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  37.3 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  33.23 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  33.57 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  29.5 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  29.03 
 
 		 471 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 542 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  33.1 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  35.02 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 450 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.99 
 
 		 513 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 531 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4079  histidine kinase  34.67 
 
 		 450 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 451 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  29.63 
 
 		 526 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  31.82 
 
 		 487 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 515 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  30.14 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 462 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.65 
 
 		 515 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4531  sensor protein QseC  31.12 
 
 		 449 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0682388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 439 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1726  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.27 
 
 		 451 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  34.91 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  32.23 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  28.73 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  28.32 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  30.18 
 
 		 468 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11101  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  29.55 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.330721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  34.73 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  31.18 
 
 		 450 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  34.94 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  29.71 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  35 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  34.44 
 
 		 484 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>