More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1617 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  100 
 
 
376 aa  743    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11101  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  56.46 
 
 
361 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.330721 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11481  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  43.8 
 
 
377 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0219905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0437  histidine kinase  43.52 
 
 
377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12411  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  36.78 
 
 
386 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0718  histidine kinase  36.17 
 
 
386 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
413 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0393  histidine kinase  36.13 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3601  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0144345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2740  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
443 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0387748  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  30.11 
 
 
409 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3368  histidine kinase  31.92 
 
 
434 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.383223  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  35.95 
 
 
392 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3459  histidine kinase  39.92 
 
 
413 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2656  histidine kinase  39.92 
 
 
413 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.265669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  31.99 
 
 
406 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  35.29 
 
 
465 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  36.59 
 
 
422 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
591 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
601 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
524 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.18 
 
 
512 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  39.09 
 
 
505 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  35.84 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  37.44 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  34.41 
 
 
416 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  34.14 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  37.71 
 
 
477 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  33.71 
 
 
387 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  36.36 
 
 
425 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  35.84 
 
 
257 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  31.42 
 
 
412 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  37.73 
 
 
524 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
412 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
350 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  29.11 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  31.02 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  36.17 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  36.29 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
460 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  27.63 
 
 
393 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.34 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
476 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  24.7 
 
 
337 aa  133  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
522 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  34.33 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
612 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  33.44 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  28.84 
 
 
473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
585 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  29.97 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  36.29 
 
 
474 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
455 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
584 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
425 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
401 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  34.27 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  36.89 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  31.88 
 
 
416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  33.62 
 
 
468 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  34.47 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
585 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.21 
 
 
467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  29.37 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  32.37 
 
 
412 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  36.89 
 
 
488 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
584 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
633 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
479 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.83 
 
 
423 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  31.52 
 
 
401 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  36.21 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.21 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
505 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  32.19 
 
 
598 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
584 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.21 
 
 
467 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  28.89 
 
 
451 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  36.21 
 
 
467 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  33.33 
 
 
416 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
430 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  35.06 
 
 
410 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.21 
 
 
467 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  32.92 
 
 
397 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
449 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.21 
 
 
467 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>