More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5169 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  100 
 
 
451 aa  895    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  77.38 
 
 
450 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  72.75 
 
 
454 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  71.46 
 
 
453 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  71.24 
 
 
453 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  71.24 
 
 
453 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  71.24 
 
 
453 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  71.24 
 
 
453 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  71.24 
 
 
453 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  71.46 
 
 
722 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  50.8 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  50.8 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 
438 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 
456 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 
426 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
441 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
441 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 
448 aa  359  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  47.37 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 
451 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
445 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 
456 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  39.26 
 
 
440 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
438 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
438 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
450 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
449 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  37.28 
 
 
440 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  32.21 
 
 
450 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  32.09 
 
 
464 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  32.47 
 
 
469 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
438 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
459 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
438 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
450 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  30.51 
 
 
459 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
444 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  30.51 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  31.92 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  30.51 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  30.51 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  32.09 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
444 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
445 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
458 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
445 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
458 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
441 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
438 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  30.51 
 
 
1093 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
448 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.94 
 
 
443 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  34.71 
 
 
455 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
450 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
453 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
438 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.35 
 
 
438 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  29.87 
 
 
449 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
433 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
438 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
487 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  29.15 
 
 
519 aa  136  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
458 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  26 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  31.31 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  27.46 
 
 
471 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
454 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  29.55 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.16 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  29.34 
 
 
448 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  29.34 
 
 
439 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
437 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
448 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
448 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  28.85 
 
 
446 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  29.38 
 
 
441 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
439 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  30.84 
 
 
439 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
444 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>