More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2897 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  100 
 
 		 571 aa  1085    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 445 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  33.07 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 427 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 487 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.62 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  36.15 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  29.61 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  31.08 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 435 aa  98.6  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 445 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  28.9 
 
 		 441 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.39 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 428 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  29.37 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 467 aa  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 427 aa  90.9  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  31.01 
 
 		 445 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  32.87 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  33.47 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  31.55 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  30.74 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 428 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  30.99 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.56 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  25 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 576 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  25.54 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  32.96 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  27.03 
 
 		 508 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  30 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  32.17 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  33.03 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  30.86 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.84 
 
 		 1162 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  34.68 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.83 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.05 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  34.31 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  23.51 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  34.21 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  23.55 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  34.31 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  34.31 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  34.31 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  34.31 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  25.56 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3903  histidine kinase  34.8 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  34.31 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0950  histidine kinase  32.54 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  31.82 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4017  sensor protein BasS/PmrB  29.93 
 
 		 364 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  33.58 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.14 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  26.95 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  33.58 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  26.95 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  34.29 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  34.29 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3837  sensor protein BasS/PmrB  29.2 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  31.43 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  31 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3618  sensor protein BasS/PmrB  32.37 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000754738  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  32.12 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  32.12 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  32.12 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  32.12 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  32.12 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  29.6 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  36.16 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  33.52 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  31.15 
 
 		 455 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 466 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 		 464 aa  67  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>