More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1156 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  862    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.24 
 
 		 445 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  58.89 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  54.02 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  57.87 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  42.34 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 487 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  40.94 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  44.98 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  38.64 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.29 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  36.87 
 
 		 433 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 345 aa  173  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  33.9 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  31.63 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.03 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  33.21 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 425 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.02 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  26.07 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  26.07 
 
 		 507 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  32.43 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  33.2 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  24.24 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 493 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  23.53 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.22 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  27.65 
 
 		 583 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 469 aa  99.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  27.44 
 
 		 450 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.96 
 
 		 1162 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  30.87 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  29.05 
 
 		 571 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  26.56 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  26.62 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 453 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1409  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  30.43 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 463 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  30.36 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 504 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  33.09 
 
 		 523 aa  96.7  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1216  histidine kinase  26.71 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  22.53 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.03 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  28.28 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  27.71 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 531 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  27.71 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.43 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 517 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 752 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  29.84 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 586 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  27.23 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.17 
 
 		 477 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  21.54 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  21.54 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  28.07 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  32 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  31.41 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  21.54 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>