More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1152 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  894    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  100 
 
 		 442 aa  894    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  38.83 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  36.69 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 432 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  38.15 
 
 		 432 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  35.58 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  35.89 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.66 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4407  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.146321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  37.05 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 442 aa  257  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5033  PAS:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.51 
 
 		 440 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  35.39 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  36.07 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.03 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 431 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  38.41 
 
 		 440 aa  252  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5478  phosphate regulon sensor protein phoR  39.24 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  36.15 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  37.04 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  37.04 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  36.02 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  37.04 
 
 		 431 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  37.04 
 
 		 431 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  36.63 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  36.54 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  36.63 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  36.63 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  34.56 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  36.52 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  36.52 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  36.54 
 
 		 431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  36.54 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  36.54 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  35.46 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  36.97 
 
 		 440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  36.48 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  37.56 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  36.92 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  36.36 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  36.1 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  39.64 
 
 		 439 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  38.5 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5607  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 440 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  36.1 
 
 		 438 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.74 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  33.5 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  35.87 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  36.43 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  35.75 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  36.99 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  36.99 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  36.99 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  36.99 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  36.99 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  36.99 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  36.71 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  36.99 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  33.72 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  34.83 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  36.27 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 465 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  37.47 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  37.47 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  37.47 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  34.82 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 439 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>