More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1819 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1819  ABC-type transporter, permease protein  100 
 
 
262 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  58.94 
 
 
256 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.78 
 
 
259 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.06 
 
 
298 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  41.39 
 
 
256 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
280 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
261 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
285 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
287 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
278 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.97 
 
 
272 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.66 
 
 
279 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
257 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
263 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
266 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
277 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  31.97 
 
 
255 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
279 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  33.33 
 
 
272 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
277 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
256 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
263 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
274 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 
279 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  32.83 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  31.31 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.62 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  28.28 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.3 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  29.73 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  33.16 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.23 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
289 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.98 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.8 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  33.52 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.05 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
273 aa  92  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.75 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  31.82 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.75 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  30.29 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.22 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.43 
 
 
279 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  26.98 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  31.61 
 
 
297 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  28.33 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.21 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.83 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.27 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.66 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  29 
 
 
272 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.06 
 
 
306 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  32.52 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  32.52 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  32.52 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  29.44 
 
 
305 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>