More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0287 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.58 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.91 
 
 
261 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.01 
 
 
285 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
256 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.77 
 
 
256 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1819  ABC-type transporter, permease protein  39.53 
 
 
262 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
263 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
258 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 
257 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
265 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  29.13 
 
 
272 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
266 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  31.12 
 
 
272 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
278 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
262 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
273 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
279 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
254 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
282 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  30.7 
 
 
272 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
286 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 
272 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
257 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3599  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
292 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
255 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
265 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
259 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00307443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
255 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
273 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
273 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
265 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
265 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
277 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
273 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  29.67 
 
 
273 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
273 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
253 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  26.58 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.88 
 
 
279 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.45 
 
 
261 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
281 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  28.57 
 
 
255 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
280 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.29 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  28.88 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  30.32 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
261 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  26.53 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1153  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  23.41 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.23101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.38 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  25.42 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  30.4 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  28.15 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  30.4 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.04 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  30.4 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  28.15 
 
 
262 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  29.01 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  28.26 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  28.57 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.81 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.58692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  29.43 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>