More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3081 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
257 aa  500  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.9 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.61 
 
 
261 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.91 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 
263 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.22 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
257 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
274 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
263 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
263 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
263 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
269 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
298 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
280 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  32.56 
 
 
272 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
263 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
279 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
252 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
271 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
255 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  32.26 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  35.26 
 
 
255 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  31.34 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
266 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
281 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
294 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  31.49 
 
 
281 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
253 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.09 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
280 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.28 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
273 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  29.1 
 
 
284 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  29.1 
 
 
284 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  29.1 
 
 
284 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  28.51 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.02 
 
 
279 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
274 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
273 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  30.4 
 
 
260 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
276 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
273 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
275 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 
281 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.9 
 
 
256 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  28.81 
 
 
263 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
272 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
279 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
254 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
285 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
283 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
291 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
273 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  32.75 
 
 
281 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.53 
 
 
262 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
267 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
536 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
239 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
279 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
532 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.57 
 
 
267 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
277 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
257 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
261 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
283 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
274 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
275 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
270 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  32.41 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.52 
 
 
262 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
267 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
269 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
261 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2408  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.67 
 
 
275 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.932342  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
283 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.63 
 
 
290 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
280 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  28.89 
 
 
256 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  28.57 
 
 
264 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.65 
 
 
293 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
264 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  31.53 
 
 
274 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>