More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5438 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
286 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
261 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  34.69 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
279 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5984  putative ABC transporter (permease protein)  38.42 
 
 
255 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.27636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
258 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.67 
 
 
256 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.93 
 
 
273 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
258 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
278 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  32.58 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  27.51 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  34.48 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  35.15 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
257 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.74 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.925  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
265 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.55 
 
 
279 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.43 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  33.62 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  33.19 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
231 aa  89  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
277 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  29.1 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.9 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  30.16 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  38.41 
 
 
284 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
273 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  38.41 
 
 
284 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
253 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  38.41 
 
 
284 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  32.22 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.3 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
280 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
255 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 
342 aa  85.5  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  27.43 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  34.39 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  33.86 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  33.86 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  33.86 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  34.39 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  31.53 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.53 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  26.59 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>