More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4670 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
259 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1819  ABC-type transporter, permease protein  51.23 
 
 
262 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  48.56 
 
 
256 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  38.19 
 
 
256 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
298 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
280 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
286 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  32 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
255 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  33.97 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
273 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
273 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.08 
 
 
271 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
277 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  34.01 
 
 
281 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
273 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
269 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  31.25 
 
 
298 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
269 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
269 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
263 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  32.68 
 
 
273 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
273 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
253 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 
279 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
279 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  30.67 
 
 
272 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
269 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
265 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.98 
 
 
279 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.61 
 
 
279 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
257 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.21 
 
 
266 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
263 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  36.87 
 
 
279 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.7 
 
 
331 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5984  putative ABC transporter (permease protein)  37.36 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.27636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  32.47 
 
 
275 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  32.47 
 
 
275 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  32.47 
 
 
275 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
271 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.43 
 
 
279 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
271 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
271 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
285 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.18 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  35.2 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.57 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  31.14 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  32.96 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.64 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  31.14 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.07 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.52 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  31.14 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.49 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  28.51 
 
 
272 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
272 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
272 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  26.87 
 
 
295 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.73 
 
 
273 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  29.82 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  30.43 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.82 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.18 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.52 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  34.64 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
297 aa  92.8  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417563  normal  0.341407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.97 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
252 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
275 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
255 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>