More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2331 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 261 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.28 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.32 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.25 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  40.24 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.04 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  34.54 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.66 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1819  ABC-type transporter, permease protein  38.31 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  36.7 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  33.05 
 
 		 272 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  33.48 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  hitchhiker  0.00170631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  34.48 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  34.48 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  34.48 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5984  putative ABC transporter (permease protein)  38.01 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.27636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  35.9 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  34.05 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  34.05 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  33.62 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  31.28 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  33.62 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.02 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.85 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.85 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.85 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  33.62 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.17 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.53 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  28.81 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.84 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.925  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  34.26 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  33.62 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.58 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  31.13 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.29 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.84 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  30.93 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  34.94 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  27.35 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>