More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3539 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
253 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
258 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.34 
 
 
273 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  32.33 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
269 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
298 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 
257 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
263 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
263 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
263 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5984  putative ABC transporter (permease protein)  28.82 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.27636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
279 aa  99  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  31.19 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  35.38 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
275 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  32.68 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  32.68 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  30.65 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  28.8 
 
 
297 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
283 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
273 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
259 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
278 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.85 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
291 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.925  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  29 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
250 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
261 aa  92  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.87 
 
 
283 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
273 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
273 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.22 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.76 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
279 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.89 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
285 aa  89  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
331 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  28.57 
 
 
299 aa  88.6  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.2 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  28.69 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
310 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
537 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  31.36 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  31.91 
 
 
282 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
281 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.78 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.04 
 
 
288 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
271 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
271 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
271 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  27.9 
 
 
305 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
293 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  33.65 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  30.04 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
254 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.64 
 
 
290 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
297 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  30.04 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.18 
 
 
311 aa  85.5  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.61 
 
 
304 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
281 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.54 
 
 
297 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
274 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  26.79 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2677  putative ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>