75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21030  RHS repeat protein  100 
 
 		 516 aa  1033    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  33.83 
 
 		 1528 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  33.12 
 
 		 2350 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.85 
 
 		 2178 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  27.49 
 
 		 1539 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.85 
 
 		 2221 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  28.08 
 
 		 1539 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.96 
 
 		 1953 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1959 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1547 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.15 
 
 		 2225 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 934 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.44 
 
 		 765 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.85 
 
 		 2224 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1551 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.85 
 
 		 2246 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.15 
 
 		 2224 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.19 
 
 		 1489 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.15 
 
 		 2224 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.02 
 
 		 1560 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1352 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.09 
 
 		 3027 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  31.93 
 
 		 1942 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  24.77 
 
 		 1732 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.91 
 
 		 1595 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  28.26 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.91 
 
 		 1586 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.79 
 
 		 1572 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  31.93 
 
 		 1669 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  33.61 
 
 		 1508 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0792  YD repeat protein  28.65 
 
 		 712 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 2096 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  30.2 
 
 		 1626 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1840 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.72 
 
 		 1550 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.49 
 
 		 1384 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1917 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2144 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 2035 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1147 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  28.35 
 
 		 2003 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.61 
 
 		 1609 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1552 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1198 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.54 
 
 		 1528 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2631  hypothetical protein  40.91 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583657  hitchhiker  0.0000138717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1197 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  30.81 
 
 		 1543 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2597  hypothetical protein  40.91 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  hitchhiker  0.000000000294879 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  30 
 
 		 863 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.62 
 
 		 2277 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  28 
 
 		 1046 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.7 
 
 		 1427 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1689 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1520 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  29.94 
 
 		 2149 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  46.75 
 
 		 1763 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  29.63 
 
 		 1485 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  30.43 
 
 		 881 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  32.58 
 
 		 1447 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.81 
 
 		 1379 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1699 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  29.94 
 
 		 6272 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1059 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  25.7 
 
 		 2075 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.37 
 
 		 3193 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.64 
 
 		 1271 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1558 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  27.27 
 
 		 1388 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.11 
 
 		 1362 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  29.36 
 
 		 1495 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 		 3273 aa  43.9  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  27.91 
 
 		 1415 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1301 aa  43.5  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35.62 
 
 		 1422 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>