175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2363 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2363  aldose 1-epimerase  100 
 
 
339 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2407  aldose 1-epimerase  100 
 
 
339 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.77718  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1926  aldose 1-epimerase  60.71 
 
 
336 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2245  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  33.54 
 
 
348 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  31.61 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  29.65 
 
 
353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  32.43 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 
354 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  31.05 
 
 
340 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  29.54 
 
 
434 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  29.06 
 
 
392 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  29.27 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  28.02 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  30.09 
 
 
392 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  26.45 
 
 
371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  27.94 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  26.35 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 
380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  30.66 
 
 
357 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  25.81 
 
 
361 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  26.49 
 
 
376 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
360 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
360 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  26.69 
 
 
355 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  28.92 
 
 
393 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  29.22 
 
 
372 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 
350 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  26.77 
 
 
362 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  26.77 
 
 
362 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  25.99 
 
 
351 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  26.56 
 
 
351 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  29.33 
 
 
347 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  29.9 
 
 
347 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 
390 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  26.38 
 
 
362 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  25.97 
 
 
362 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  27.54 
 
 
387 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  26.46 
 
 
362 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  27.14 
 
 
356 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  25.93 
 
 
351 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  29.74 
 
 
341 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  27.14 
 
 
356 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  26.32 
 
 
346 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  26.32 
 
 
346 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  26.02 
 
 
346 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 
346 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  26.07 
 
 
346 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
346 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 
360 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  27.11 
 
 
351 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
346 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
346 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
346 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
346 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  26.02 
 
 
346 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 
397 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0996  aldose 1-epimerase  27.53 
 
 
327 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0348  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 
335 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0152282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  25.87 
 
 
346 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  24.4 
 
 
362 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  26.93 
 
 
351 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  28.06 
 
 
341 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
355 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
346 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  26.81 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  27.7 
 
 
438 aa  99.4  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  25.56 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  24.52 
 
 
406 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  29.36 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  30.63 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  26.27 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  25.91 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  25.99 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  25.98 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  25.98 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  23.94 
 
 
414 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1320  aldose 1-epimerase  27.42 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.249938  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  25.29 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  25.84 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  24.49 
 
 
361 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1311  aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
331 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  27.19 
 
 
351 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  26.37 
 
 
387 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  25.44 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  27.67 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  25.61 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  26.51 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  27.51 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  26.51 
 
 
356 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  24.41 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>