173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1926 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1926  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 336 aa  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2363  aldose 1-epimerase  60.71 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2407  aldose 1-epimerase  60.71 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.77718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2245  aldose 1-epimerase  33.55 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  31.63 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  29.88 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  28.94 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  31.05 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  27.71 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  25.76 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  27.82 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  28.27 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  24.48 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  26.33 
 
 		 434 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  27.93 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  28.23 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  24.93 
 
 		 371 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  27.05 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  26.11 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  26.17 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  28.17 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  25.3 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  26.05 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  24.09 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  24.09 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  25.15 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  23.65 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  23.65 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  24.84 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  24.39 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  23.94 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  26.98 
 
 		 384 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  26.98 
 
 		 397 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  24.05 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  29.23 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  29.23 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  28.13 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  23.48 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  26.38 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  33.75 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1320  aldose 1-epimerase  26.21 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.249938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  25.78 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  23.91 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  24.86 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  29.8 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  23.91 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  23.91 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  23.99 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  36.63 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  24.15 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  27.7 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  29.8 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  25.34 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  27.3 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  25.94 
 
 		 354 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  29.29 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  26.61 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  25.52 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  25.3 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  24.01 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  24.17 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  24.27 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  23.24 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  26.25 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  29.28 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  23.98 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  27.67 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  31.45 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1593  aldose 1-epimerase  27.72 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  23.68 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  24.53 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  26.73 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  23.98 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  23.98 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  30.14 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  27.35 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  26.65 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  26.17 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  26.06 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  24.01 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  23.97 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  23.97 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  28.67 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  23.97 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>