More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2876 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2876  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 315 aa  603  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1936  porphobilinogen deaminase  60.52 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0833928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2786  porphobilinogen deaminase  57.28 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  48.54 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  52.88 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  52.71 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  52.35 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  47.78 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  52.16 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  51.26 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  52.88 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  51.93 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  49.28 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  44.66 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  51.1 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  44.66 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  48.2 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  48.85 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  47.62 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  46.81 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  47.86 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  44.71 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  45.61 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  47.72 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  45.68 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  47.81 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  47.62 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  47.14 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.49 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  49.44 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 351 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  44.63 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  44.16 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  47.5 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  49.81 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  46.88 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  47.45 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  43.83 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  43.83 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  49.04 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  45.91 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.62 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  46.24 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  42.75 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  50.92 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.75 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  48.46 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  44.8 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  46.24 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  46.24 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  43.49 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  43.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  44.26 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  44.04 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  45.76 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0710  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>