More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0173 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  56.94 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  53.27 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  50.93 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  55.78 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  55.78 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  55.78 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  50.91 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  54.55 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  54.55 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  53.46 
 
 		 245 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  58.62 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 		 233 aa  208  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  58.29 
 
 		 247 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  49.51 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  55.32 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  54.46 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  48.4 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  49.26 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  55.05 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  49.49 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  46.97 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  51.27 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  51.23 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  46.72 
 
 		 239 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  47.47 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  49.74 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  46.01 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  47.72 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  45.85 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  45.55 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  45.55 
 
 		 198 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.71 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 		 178 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 		 176 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 		 182 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  40.23 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  44.75 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  44.13 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  41.48 
 
 		 180 aa  151  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  41.14 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  45.14 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  39.78 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  39.89 
 
 		 184 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.8 
 
 		 334 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  42.6 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  41.95 
 
 		 204 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  37.85 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.14 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.99 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  39.11 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  41.04 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  37.3 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.45 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  37.02 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.06 
 
 		 301 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  42.08 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  40.34 
 
 		 179 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.66 
 
 		 305 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  38.76 
 
 		 180 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.41 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  41.9 
 
 		 181 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.9 
 
 		 287 aa  141  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.33 
 
 		 301 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  41.95 
 
 		 182 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  40.23 
 
 		 181 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.66 
 
 		 301 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  40.23 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.33 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  41.53 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  40.23 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35.68 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.66 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.02 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.78 
 
 		 301 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.56 
 
 		 338 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  43.35 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.78 
 
 		 301 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  44.63 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  38.24 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.57 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  39.31 
 
 		 180 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  41.38 
 
 		 175 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>