More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4498 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  90.65 
 
 		 246 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  79.34 
 
 		 245 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  66.96 
 
 		 243 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  62.45 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  67.13 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  63.27 
 
 		 247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  61.07 
 
 		 246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  69.19 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  69.19 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  61.07 
 
 		 246 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  67.59 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  64.18 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  63.73 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  54.25 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  58.69 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  53.11 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  57.28 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  57 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  56.04 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  52.81 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  55.39 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  54.3 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  56.78 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  55.15 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  52.02 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  52.17 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  52.04 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  54.41 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 240 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  50.23 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  51.22 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  52.82 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  52.82 
 
 		 198 aa  208  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  48.68 
 
 		 262 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.99 
 
 		 301 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 		 178 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.45 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 197 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.95 
 
 		 301 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.9 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.29 
 
 		 180 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.45 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  41.54 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  36.2 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.29 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  41.36 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 179 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.81 
 
 		 301 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.81 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  45.09 
 
 		 190 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.81 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.63 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 180 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.26 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  38.79 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  43.75 
 
 		 176 aa  158  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  40.55 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  39.37 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  43.43 
 
 		 180 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.22 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 183 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 186 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  42.35 
 
 		 177 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  43.35 
 
 		 175 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 		 177 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.88 
 
 		 301 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 186 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  45.14 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 		 183 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 		 204 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  43.27 
 
 		 182 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.44 
 
 		 176 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  41.76 
 
 		 178 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  42.69 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  44.44 
 
 		 199 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.25 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  40.68 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.93 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  40.11 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.35 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  42.44 
 
 		 182 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 181 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  43.09 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>