More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1694 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 239 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  68.8 
 
 		 234 aa  323  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  56.31 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  56.22 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  55.34 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  56.85 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  56.85 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  55.1 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  54.9 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  48.89 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 245 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  53.47 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  51.35 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  55.84 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  55.84 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  55.61 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  55.84 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  55.33 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  50.24 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  52.82 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  53.27 
 
 		 236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  52.04 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  51.53 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  51.78 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  50.24 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  53.89 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  47.78 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  50.5 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  50.73 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  45.25 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  50.75 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  48.56 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  48.73 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  50.26 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  50.27 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  47.64 
 
 		 198 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  47.64 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.02 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.75 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.2 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.65 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.4 
 
 		 302 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.22 
 
 		 301 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.18 
 
 		 301 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.22 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.22 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  40.58 
 
 		 209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  43.35 
 
 		 180 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  43.2 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  44.07 
 
 		 186 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  43.27 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.91 
 
 		 180 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  39.79 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  36.74 
 
 		 210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  43.86 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  43.1 
 
 		 182 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.47 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  43.86 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  43.86 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  40.8 
 
 		 180 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  33 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.96 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  39.88 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  40.83 
 
 		 179 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  43.86 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.85 
 
 		 334 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 293 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  36.21 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 299 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  42.26 
 
 		 186 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  44.71 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  40.35 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  37.25 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  41.18 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  39.2 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  39.88 
 
 		 179 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  42.35 
 
 		 182 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 184 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  39.2 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  41.14 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.4 
 
 		 290 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  39.77 
 
 		 182 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  42.05 
 
 		 182 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  42.35 
 
 		 183 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  40.23 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>