More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6004 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  87.01 
 
 
234 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  62.03 
 
 
243 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  68.32 
 
 
236 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  71 
 
 
236 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  68.81 
 
 
238 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  59.75 
 
 
249 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  64.88 
 
 
246 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  64.59 
 
 
240 aa  287  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  63.33 
 
 
246 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  64.9 
 
 
235 aa  284  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  64.39 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  64.08 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  62.05 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  62.83 
 
 
246 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  58.26 
 
 
242 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 
247 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  60.39 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 
246 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  58.74 
 
 
247 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  58.74 
 
 
247 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  58.25 
 
 
247 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  57.35 
 
 
247 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  53.11 
 
 
245 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  59.24 
 
 
233 aa  254  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  59.8 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  63.59 
 
 
238 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
243 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  59.31 
 
 
240 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  59.49 
 
 
240 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  59.14 
 
 
246 aa  238  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  53.67 
 
 
225 aa  234  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
229 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  51.77 
 
 
239 aa  228  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  54.9 
 
 
245 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  58.89 
 
 
234 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  49.48 
 
 
211 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  49.48 
 
 
198 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  51.83 
 
 
216 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  49.5 
 
 
229 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  51.61 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  40.09 
 
 
266 aa  178  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  46.96 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
180 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  47.06 
 
 
197 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.89 
 
 
190 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  40.84 
 
 
208 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.31 
 
 
201 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.33 
 
 
180 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.11 
 
 
301 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
182 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
185 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.11 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  45.35 
 
 
178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.11 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 
184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.92 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  50.59 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  47.06 
 
 
176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.56 
 
 
302 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  47.16 
 
 
182 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.78 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  41.21 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  42.7 
 
 
180 aa  161  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.76 
 
 
181 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.71 
 
 
301 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 
186 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.28 
 
 
338 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  52.38 
 
 
158 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45 
 
 
301 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  41.9 
 
 
204 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 
182 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 
180 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
179 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  44.71 
 
 
175 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 
179 aa  158  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.86 
 
 
183 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
301 aa  158  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 
181 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.03 
 
 
301 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 
210 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.68 
 
 
305 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.03 
 
 
301 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 
180 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 
186 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  42.13 
 
 
186 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 
186 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  45.2 
 
 
199 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.47 
 
 
333 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.63 
 
 
334 aa  155  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
181 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.27 
 
 
179 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.62 
 
 
184 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.5 
 
 
287 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  42.22 
 
 
186 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>