More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0158 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  62.16 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  55.2 
 
 
238 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  60.21 
 
 
240 aa  235  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  59.16 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  58.76 
 
 
229 aa  232  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
246 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  53.67 
 
 
235 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  56.82 
 
 
248 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  53.77 
 
 
246 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  57.59 
 
 
245 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  55.05 
 
 
243 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  53.69 
 
 
245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  51.8 
 
 
233 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  55.9 
 
 
234 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  53.27 
 
 
249 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  53.09 
 
 
236 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  53.81 
 
 
246 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  55.98 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  54.59 
 
 
246 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  54.59 
 
 
246 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  48.25 
 
 
245 aa  215  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  51.72 
 
 
235 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  52.15 
 
 
242 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  50.25 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  53.72 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  53.72 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  53.72 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  53.26 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  52.06 
 
 
236 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  53.3 
 
 
225 aa  210  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  50.79 
 
 
240 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  48.11 
 
 
229 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  52.85 
 
 
236 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  47.78 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  45.25 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
262 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  51.14 
 
 
234 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
216 aa  187  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  48.13 
 
 
198 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  48.13 
 
 
211 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
209 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 
186 aa  164  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.94 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 
182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.63 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 
180 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.71 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.51 
 
 
178 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  47.4 
 
 
176 aa  161  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.09 
 
 
190 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.9 
 
 
334 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 
225 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.51 
 
 
305 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 
180 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  41.15 
 
 
228 aa  158  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.71 
 
 
290 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 
201 aa  158  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  45.75 
 
 
220 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 
180 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
228 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
210 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 
175 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 
182 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
180 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 
208 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 
179 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 
178 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  43.48 
 
 
204 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  45.61 
 
 
175 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  44.12 
 
 
178 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  43.45 
 
 
180 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.29 
 
 
301 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
184 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
181 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
181 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.97 
 
 
333 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 
183 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 
184 aa  151  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  40.68 
 
 
219 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.23 
 
 
301 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.71 
 
 
181 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.92 
 
 
338 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  47.43 
 
 
178 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.44 
 
 
302 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.17 
 
 
284 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  44.07 
 
 
179 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  43.79 
 
 
180 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  44.58 
 
 
179 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 
181 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.89 
 
 
186 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
277 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  44.89 
 
 
186 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.11 
 
 
301 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.34 
 
 
301 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
185 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
185 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  43.02 
 
 
180 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
185 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>