More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1129 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  78.16 
 
 
236 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  76.3 
 
 
236 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  68.91 
 
 
235 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  77.14 
 
 
238 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  73.24 
 
 
236 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  66.2 
 
 
234 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  62.72 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  65.48 
 
 
235 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  58.3 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  58.48 
 
 
249 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  58.22 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  57.49 
 
 
246 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  56.14 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  51.22 
 
 
245 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  58.21 
 
 
233 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  56.04 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  56.22 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  56.22 
 
 
247 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  56.22 
 
 
247 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  55.38 
 
 
238 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 
245 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 
240 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  58.73 
 
 
247 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  57.67 
 
 
246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  54.87 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  54.59 
 
 
225 aa  232  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  55.78 
 
 
247 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  54.74 
 
 
243 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  50.21 
 
 
239 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  54.69 
 
 
229 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  54.35 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  56.42 
 
 
234 aa  218  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
211 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  54.55 
 
 
198 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  48.4 
 
 
225 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  49.26 
 
 
262 aa  200  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  52.22 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 
178 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.56 
 
 
197 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 
185 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
190 aa  175  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  45.4 
 
 
178 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  47.73 
 
 
180 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.52 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.93 
 
 
201 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
182 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.46 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  49.13 
 
 
180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.61 
 
 
301 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.93 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.95 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.93 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.65 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 
183 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.48 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
183 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 
184 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 
208 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
180 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
178 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.88 
 
 
301 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
228 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.39 
 
 
225 aa  167  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.47 
 
 
301 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 
182 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.09 
 
 
186 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  48.24 
 
 
176 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  43.17 
 
 
209 aa  165  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.09 
 
 
182 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
181 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
181 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
186 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.4 
 
 
181 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.81 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.49 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.6 
 
 
338 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  51.74 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.35 
 
 
182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 
181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  41.99 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  43.35 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
177 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.34 
 
 
184 aa  162  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
186 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
186 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.82 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  46.51 
 
 
182 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.51 
 
 
305 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  45.09 
 
 
180 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
185 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
185 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
185 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>