More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0467 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
245 aa  493  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  55.51 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  55.7 
 
 
248 aa  241  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  57.58 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  53.81 
 
 
245 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  57.21 
 
 
236 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  57.58 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  57.07 
 
 
246 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  52.75 
 
 
243 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  61.45 
 
 
247 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  54.9 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  57.5 
 
 
236 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  61.45 
 
 
247 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  61.45 
 
 
247 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  56.78 
 
 
247 aa  234  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  56.1 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  55.71 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  54.63 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  52.47 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  54.59 
 
 
238 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  54.9 
 
 
234 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  49.78 
 
 
243 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  54.11 
 
 
236 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  55.84 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  54 
 
 
246 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 
246 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  53.57 
 
 
225 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  57.22 
 
 
238 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  57.78 
 
 
240 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  48.25 
 
 
225 aa  215  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  57.78 
 
 
240 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
246 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  54.19 
 
 
229 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  54.4 
 
 
239 aa  207  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  54.45 
 
 
262 aa  204  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  45.74 
 
 
229 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  49.22 
 
 
216 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  47.5 
 
 
211 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  47.45 
 
 
198 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44.92 
 
 
228 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
181 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
178 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
180 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.13 
 
 
301 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.38 
 
 
301 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  44.32 
 
 
197 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  47.09 
 
 
176 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  43.58 
 
 
184 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 
184 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  42.02 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.28 
 
 
290 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.51 
 
 
301 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.83 
 
 
301 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.82 
 
 
301 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.82 
 
 
301 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  52.45 
 
 
158 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.51 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.82 
 
 
302 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.13 
 
 
184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.51 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.91 
 
 
177 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 
182 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  44.91 
 
 
179 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44 
 
 
181 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  48.54 
 
 
177 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  43.82 
 
 
185 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  42.6 
 
 
181 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 
178 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 
180 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  43.35 
 
 
180 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  43.71 
 
 
180 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
177 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  40.19 
 
 
228 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  42.6 
 
 
181 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  43.6 
 
 
175 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
209 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  50.32 
 
 
212 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  43.83 
 
 
178 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  43.9 
 
 
225 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 
183 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  43.71 
 
 
180 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
182 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  43.11 
 
 
179 aa  158  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 
186 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
182 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
183 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  40.35 
 
 
178 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
183 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  46.62 
 
 
165 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  41.42 
 
 
179 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  46.63 
 
 
184 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.52 
 
 
333 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 
178 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  44.51 
 
 
186 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.93 
 
 
338 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>