More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2276 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
165 aa  344  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  61.01 
 
 
164 aa  204  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  58.97 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  58.33 
 
 
156 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  55.62 
 
 
162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 
266 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  55.78 
 
 
150 aa  181  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  57.64 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  56 
 
 
176 aa  179  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  54.37 
 
 
165 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  54.72 
 
 
162 aa  178  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
184 aa  177  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  55.17 
 
 
181 aa  177  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 
158 aa  176  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 
183 aa  174  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  53.02 
 
 
178 aa  175  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  49.38 
 
 
228 aa  174  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  54.84 
 
 
162 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  54 
 
 
181 aa  174  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
182 aa  171  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  54.19 
 
 
197 aa  171  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  52.23 
 
 
184 aa  171  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
155 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  51.32 
 
 
176 aa  170  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 
186 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 
208 aa  169  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  52.63 
 
 
179 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
182 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  53.21 
 
 
243 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 
179 aa  167  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.38 
 
 
301 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.33 
 
 
300 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.38 
 
 
301 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.38 
 
 
301 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  55.33 
 
 
177 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  51.59 
 
 
159 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  48.37 
 
 
190 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.67 
 
 
301 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.38 
 
 
301 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.74 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.17 
 
 
301 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  54.11 
 
 
210 aa  164  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.78 
 
 
301 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.78 
 
 
301 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 
183 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.32 
 
 
186 aa  164  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  52.67 
 
 
182 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  51.32 
 
 
186 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  51.01 
 
 
175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  53.25 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.17 
 
 
302 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.34 
 
 
301 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.3 
 
 
351 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.2 
 
 
305 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 
220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  51.7 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 
159 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 
153 aa  161  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 
180 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  54.17 
 
 
179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  50.33 
 
 
178 aa  160  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 
225 aa  160  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.03 
 
 
334 aa  160  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  49.34 
 
 
178 aa  160  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.04 
 
 
305 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  52.67 
 
 
186 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 
181 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  49.34 
 
 
186 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  51.3 
 
 
159 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
182 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
290 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 
181 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 
157 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 
159 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
182 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  49.07 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  49.07 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  158  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
209 aa  158  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
159 aa  157  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  51.33 
 
 
199 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
183 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.08 
 
 
287 aa  157  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 
179 aa  157  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 
159 aa  157  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  46.62 
 
 
245 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  52.05 
 
 
212 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 
185 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>