More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1784 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 159 aa  336  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  86.79 
 
 		 159 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  86.16 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 159 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 159 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 159 aa  278  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  79.25 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  78.62 
 
 		 159 aa  276  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  78.62 
 
 		 159 aa  275  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  77.99 
 
 		 159 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  77.99 
 
 		 159 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  76.58 
 
 		 164 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  77.36 
 
 		 159 aa  263  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  74.84 
 
 		 159 aa  261  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  72.96 
 
 		 159 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  56.77 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  54.14 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 150 aa  175  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 225 aa  173  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  55.35 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  57.89 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  54 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  51.92 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 228 aa  166  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  56.21 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  50.97 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.47 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.73 
 
 		 300 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 		 191 aa  157  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.06 
 
 		 181 aa  157  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 		 266 aa  158  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 		 211 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.33 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  50.97 
 
 		 222 aa  157  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 		 186 aa  156  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 		 180 aa  156  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.43 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 397 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  52.67 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.03 
 
 		 311 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.68 
 
 		 290 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 		 184 aa  154  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  49.32 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  47.1 
 
 		 180 aa  153  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  48.3 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 		 260 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 		 219 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.25 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  48.34 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.66 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  49.67 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.99 
 
 		 309 aa  148  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  49.33 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.79 
 
 		 305 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 211 aa  147  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 		 212 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  48.1 
 
 		 220 aa  147  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 		 213 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 220 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  46.94 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  49.36 
 
 		 218 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 353 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.33 
 
 		 321 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  47.17 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 368 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  49.33 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  50.31 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.97 
 
 		 301 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.62 
 
 		 301 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 		 213 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.25 
 
 		 301 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 221 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.63 
 
 		 301 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.32 
 
 		 301 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.32 
 
 		 301 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  50.67 
 
 		 328 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>