More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1523 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 212 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  63.59 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  57.56 
 
 		 211 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  67.26 
 
 		 214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  66.07 
 
 		 211 aa  248  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  60.89 
 
 		 200 aa  243  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  55.94 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  65.09 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  63.22 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  54.27 
 
 		 368 aa  229  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  62.72 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  53.57 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  59.41 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  57.8 
 
 		 353 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.8 
 
 		 321 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  56.32 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  53.03 
 
 		 198 aa  211  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 198 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  53.67 
 
 		 260 aa  201  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  54.97 
 
 		 323 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  46.53 
 
 		 380 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  53.76 
 
 		 321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  51.81 
 
 		 351 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  45.54 
 
 		 380 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.76 
 
 		 321 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  54.44 
 
 		 328 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  53.76 
 
 		 321 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  53.18 
 
 		 321 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  53.76 
 
 		 321 aa  197  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  53.18 
 
 		 321 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.18 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 		 416 aa  196  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.87 
 
 		 321 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  53.8 
 
 		 320 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.5 
 
 		 416 aa  194  9e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.3 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.3 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  52.91 
 
 		 397 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  45.59 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  51.76 
 
 		 170 aa  191  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  42.18 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  52.98 
 
 		 175 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  46.23 
 
 		 394 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 169 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  51.19 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  47.45 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  44.04 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 178 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 178 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  50.89 
 
 		 175 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  55.03 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  56.67 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  47.65 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  47.65 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  45.5 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  52.9 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  58.22 
 
 		 150 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  48.24 
 
 		 174 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  44.06 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  48.82 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  42.93 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  41.31 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  53.64 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 155 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  55.17 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  47.15 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 153 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.62 
 
 		 290 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  43.72 
 
 		 280 aa  165  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.85 
 
 		 338 aa  164  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  45.09 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  51.75 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.48 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  50.94 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 186 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.61 
 
 		 311 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  49.33 
 
 		 183 aa  161  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.11 
 
 		 334 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.1 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>