More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2331 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 159 aa  333  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 159 aa  277  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  77.99 
 
 		 159 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  73.58 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  73.58 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  73.58 
 
 		 159 aa  256  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  72.96 
 
 		 159 aa  256  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  73.58 
 
 		 159 aa  256  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  73.58 
 
 		 159 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  71.7 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  71.7 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  72.96 
 
 		 159 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  71.7 
 
 		 159 aa  254  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  71.07 
 
 		 159 aa  253  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  72.96 
 
 		 159 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  71.07 
 
 		 159 aa  248  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  71.52 
 
 		 164 aa  246  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  55.48 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  53.5 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  55.63 
 
 		 162 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  58 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  51.97 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  51.66 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 225 aa  161  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.41 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  49.35 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  47.74 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.73 
 
 		 300 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 		 178 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  48.99 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  51.33 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.1 
 
 		 290 aa  153  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 		 184 aa  153  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 		 208 aa  153  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 		 223 aa  152  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  51.02 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  52.17 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 311 aa  151  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 		 191 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.74 
 
 		 305 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  46.98 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.33 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 		 266 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  47.8 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.27 
 
 		 186 aa  148  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 		 220 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.74 
 
 		 334 aa  147  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  50.64 
 
 		 229 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.39 
 
 		 322 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  49.34 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  49.34 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0621  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.98 
 
 		 309 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  45.27 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.65 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 221 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  46.3 
 
 		 222 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  51.3 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 		 213 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  48.1 
 
 		 220 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  45.95 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  44.52 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.74 
 
 		 333 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 		 213 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  47.17 
 
 		 212 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  44.65 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.9 
 
 		 182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.9 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  45.28 
 
 		 212 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  51.33 
 
 		 225 aa  144  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 368 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.68 
 
 		 212 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 180 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 		 183 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  48.03 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  48.03 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 		 178 aa  143  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  48.03 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.67 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>