More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2948 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
322 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.82 
 
 
311 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.09 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.19 
 
 
334 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.06 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  69.33 
 
 
155 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.86 
 
 
286 aa  215  9e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  69.18 
 
 
158 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.67 
 
 
334 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.87 
 
 
338 aa  208  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.74 
 
 
287 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  61.04 
 
 
212 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  65.99 
 
 
351 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  64.58 
 
 
368 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.33 
 
 
284 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  64.34 
 
 
323 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35.53 
 
 
284 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.89 
 
 
351 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35.2 
 
 
284 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  56.6 
 
 
167 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
181 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  66.92 
 
 
320 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  62.5 
 
 
151 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  62.42 
 
 
150 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  54.66 
 
 
168 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  57.24 
 
 
394 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  62.59 
 
 
153 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  60.81 
 
 
368 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  54.72 
 
 
169 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  55.28 
 
 
168 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  57.82 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  65.65 
 
 
191 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  54.66 
 
 
168 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35 
 
 
289 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  54.04 
 
 
168 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  52.17 
 
 
168 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  55.97 
 
 
179 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  63.7 
 
 
328 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  50.63 
 
 
162 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  54.09 
 
 
162 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
172 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  60.29 
 
 
321 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
169 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  54.09 
 
 
167 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  59.56 
 
 
321 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.03 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  61.81 
 
 
158 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  61.87 
 
 
187 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.56 
 
 
321 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  59.56 
 
 
321 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.56 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.77 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  64.18 
 
 
154 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
321 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
169 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.07 
 
 
352 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  52.83 
 
 
169 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  59.03 
 
 
202 aa  178  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.67 
 
 
289 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  54.09 
 
 
172 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  57.05 
 
 
405 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  54.09 
 
 
182 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35.27 
 
 
300 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  56.69 
 
 
169 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
179 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  55.35 
 
 
179 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  57.45 
 
 
397 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
175 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  54.66 
 
 
177 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.47 
 
 
305 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 
141 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  54.72 
 
 
173 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  52.53 
 
 
178 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
168 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  55.13 
 
 
171 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  55.13 
 
 
171 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  54.76 
 
 
179 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  55.13 
 
 
171 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  51.88 
 
 
168 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
375 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
166 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  57.23 
 
 
178 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  55.41 
 
 
169 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  52.5 
 
 
166 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  52.5 
 
 
166 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.45 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 
170 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  55.03 
 
 
364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
148 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.9 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  50.94 
 
 
171 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  53.29 
 
 
385 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  62.59 
 
 
186 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  52.7 
 
 
380 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  55.26 
 
 
155 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.56 
 
 
301 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>