More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1105 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
169 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  96.45 
 
 
169 aa  347  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  89.35 
 
 
171 aa  327  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  89.35 
 
 
171 aa  327  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  88.76 
 
 
171 aa  326  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  78.31 
 
 
182 aa  288  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 
173 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  76.69 
 
 
178 aa  277  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  77.3 
 
 
179 aa  276  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 
169 aa  275  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 
168 aa  274  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 
168 aa  272  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  75.76 
 
 
169 aa  271  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 
169 aa  270  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  75.78 
 
 
168 aa  270  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  76.4 
 
 
168 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  75.9 
 
 
179 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  76.69 
 
 
170 aa  268  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  73.78 
 
 
175 aa  267  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 
172 aa  266  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  74.53 
 
 
168 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  75.16 
 
 
168 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  74.1 
 
 
171 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  73.46 
 
 
172 aa  261  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 
177 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  74.53 
 
 
168 aa  260  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  75.46 
 
 
172 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  74.23 
 
 
169 aa  258  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  72.56 
 
 
171 aa  255  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  73.91 
 
 
166 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  70.91 
 
 
179 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  67.9 
 
 
167 aa  248  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  70.3 
 
 
179 aa  248  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  70.99 
 
 
167 aa  246  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  67.92 
 
 
162 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  67.7 
 
 
166 aa  239  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  67.08 
 
 
166 aa  233  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  62.89 
 
 
168 aa  222  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.13 
 
 
311 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.69 
 
 
322 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 
162 aa  174  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 
180 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.64 
 
 
290 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.68 
 
 
287 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 
181 aa  150  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.3 
 
 
284 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 
186 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.72 
 
 
338 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  45.51 
 
 
213 aa  148  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 
155 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
229 aa  147  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  46.05 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 
334 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  47.13 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.79 
 
 
333 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.41 
 
 
197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  46.58 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  49.01 
 
 
212 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
178 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 
183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 
182 aa  144  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  43.4 
 
 
225 aa  144  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.91 
 
 
334 aa  144  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  44.65 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  45.58 
 
 
180 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.58 
 
 
184 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  47.59 
 
 
158 aa  141  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
182 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.16 
 
 
184 aa  141  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  42.21 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  46.15 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
236 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  46.31 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.48 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.21 
 
 
351 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.14 
 
 
284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  40.62 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  48.59 
 
 
189 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  42.24 
 
 
173 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 
180 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  46.21 
 
 
156 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.14 
 
 
284 aa  138  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  42.31 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  43.64 
 
 
191 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  44.94 
 
 
186 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  45.27 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.95 
 
 
286 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  46.26 
 
 
164 aa  136  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.3 
 
 
195 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
262 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  43.59 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  43.51 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  43.51 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 
228 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>