More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4138 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 168 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  94.05 
 
 		 168 aa  341  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 		 168 aa  320  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 		 168 aa  320  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  84.52 
 
 		 168 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  84.15 
 
 		 172 aa  304  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  83.13 
 
 		 173 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  82.82 
 
 		 169 aa  296  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  82.72 
 
 		 169 aa  295  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  82.72 
 
 		 169 aa  294  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  81.1 
 
 		 172 aa  293  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  78.44 
 
 		 179 aa  292  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  79.88 
 
 		 172 aa  291  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  78.44 
 
 		 175 aa  290  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  80.98 
 
 		 168 aa  290  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  82.63 
 
 		 177 aa  289  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  77.91 
 
 		 169 aa  288  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  79.88 
 
 		 170 aa  288  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 182 aa  287  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  77.25 
 
 		 179 aa  285  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  79.27 
 
 		 168 aa  282  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 171 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  77.78 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  77.44 
 
 		 171 aa  277  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 		 171 aa  273  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 		 171 aa  273  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  76.69 
 
 		 171 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  74.85 
 
 		 178 aa  268  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  76.07 
 
 		 179 aa  267  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  75.78 
 
 		 169 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  73.65 
 
 		 167 aa  266  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  75.16 
 
 		 169 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 162 aa  258  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  73.12 
 
 		 166 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 166 aa  247  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  65.27 
 
 		 167 aa  246  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  65.41 
 
 		 168 aa  236  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.88 
 
 		 311 aa  222  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.04 
 
 		 322 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  48.81 
 
 		 213 aa  161  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 		 229 aa  160  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.15 
 
 		 197 aa  157  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.65 
 
 		 186 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 		 183 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 		 178 aa  154  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.62 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.1 
 
 		 287 aa  154  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.53 
 
 		 338 aa  153  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.02 
 
 		 351 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.58 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.06 
 
 		 333 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  46.91 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.68 
 
 		 290 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  48.7 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 		 236 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.4 
 
 		 334 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 284 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 		 180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.65 
 
 		 209 aa  144  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.22 
 
 		 334 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 284 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  49.34 
 
 		 235 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  49.01 
 
 		 240 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  44.1 
 
 		 182 aa  143  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  41.98 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.58 
 
 		 284 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.77 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 		 236 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  42.59 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  50.33 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 228 aa  141  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  47.85 
 
 		 178 aa  140  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  47.02 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.94 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.33 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 		 246 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  45.29 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  47.17 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  47.26 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  45.81 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  44.24 
 
 		 204 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 214 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  41.57 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  44.3 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>