More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1980 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
204 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  60.59 
 
 
211 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  66.67 
 
 
211 aa  267  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  66.67 
 
 
214 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  62.79 
 
 
212 aa  240  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  54.55 
 
 
212 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  59.17 
 
 
208 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  53.03 
 
 
200 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  55.73 
 
 
191 aa  224  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  59.2 
 
 
191 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  52.04 
 
 
198 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  55.95 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  56.55 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  55.49 
 
 
183 aa  207  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  49.48 
 
 
353 aa  207  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  48.51 
 
 
208 aa  204  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.83 
 
 
321 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  50.83 
 
 
321 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.83 
 
 
321 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.28 
 
 
321 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.83 
 
 
321 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.28 
 
 
321 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 
321 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.28 
 
 
321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  50.28 
 
 
321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 
321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 
321 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  54.22 
 
 
213 aa  197  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  51.19 
 
 
416 aa  193  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  52.66 
 
 
323 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.6 
 
 
416 aa  192  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 
368 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  48.86 
 
 
260 aa  191  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  50 
 
 
170 aa  189  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  51.18 
 
 
175 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 
178 aa  187  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  52.07 
 
 
201 aa  186  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
178 aa  185  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 
178 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 
178 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  51.48 
 
 
328 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  50.59 
 
 
320 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 
178 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  49.01 
 
 
196 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 
178 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
178 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  52.07 
 
 
169 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
198 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  47.26 
 
 
197 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  47.62 
 
 
397 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 
155 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  41.5 
 
 
394 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  44.67 
 
 
203 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  41.67 
 
 
351 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  45.18 
 
 
203 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  43.07 
 
 
223 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  41.62 
 
 
380 aa  174  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  51.66 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  41.12 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  45.08 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  54.42 
 
 
156 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  41.62 
 
 
380 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  46.51 
 
 
177 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  46.51 
 
 
177 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 
211 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
213 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
175 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  43.16 
 
 
198 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  45.05 
 
 
195 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  52.26 
 
 
183 aa  169  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  43.35 
 
 
223 aa  167  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
381 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
208 aa  165  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  52.29 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  53.42 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  46.15 
 
 
174 aa  164  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 
150 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  47.83 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 
158 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 
185 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 
180 aa  162  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.02 
 
 
181 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
209 aa  161  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  51.66 
 
 
171 aa  161  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 
225 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 
184 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  38.83 
 
 
226 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
183 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  40.21 
 
 
228 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.62 
 
 
266 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.32 
 
 
322 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 
182 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>