More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2013 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
156 aa  329  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  66.67 
 
 
158 aa  229  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  68.67 
 
 
155 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  65.16 
 
 
164 aa  219  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  63.64 
 
 
162 aa  215  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  65.33 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  62.58 
 
 
162 aa  209  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  61.44 
 
 
163 aa  205  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  61.49 
 
 
150 aa  202  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  58.33 
 
 
165 aa  192  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  56.67 
 
 
162 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  56.95 
 
 
165 aa  187  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
158 aa  186  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  54.78 
 
 
159 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  54.55 
 
 
164 aa  184  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
219 aa  183  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 
225 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  55.06 
 
 
229 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  55 
 
 
212 aa  180  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  55 
 
 
212 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  54.78 
 
 
159 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  55 
 
 
212 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50.97 
 
 
185 aa  180  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  54.78 
 
 
159 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  54.78 
 
 
159 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  54.09 
 
 
213 aa  179  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.56 
 
 
351 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  55.97 
 
 
216 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  57.43 
 
 
211 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  54.43 
 
 
221 aa  178  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  62.75 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  52.83 
 
 
212 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  59.18 
 
 
222 aa  177  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  57.86 
 
 
220 aa  177  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  54.14 
 
 
159 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  177  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  54.72 
 
 
212 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  53.5 
 
 
159 aa  176  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  57.43 
 
 
214 aa  176  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  56.33 
 
 
213 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  55.7 
 
 
213 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.59 
 
 
159 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  56.08 
 
 
183 aa  175  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  53.5 
 
 
159 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 
212 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 
212 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  55.92 
 
 
212 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 
212 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 
212 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 
212 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  56.86 
 
 
212 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  55.92 
 
 
212 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  57.62 
 
 
219 aa  173  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 
212 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 
211 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  52.41 
 
 
181 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  56.33 
 
 
213 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  51.88 
 
 
213 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  54.42 
 
 
204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  55.26 
 
 
212 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  56.21 
 
 
212 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  55.26 
 
 
212 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 
216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  55.26 
 
 
212 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  53.5 
 
 
222 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  50.31 
 
 
212 aa  170  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  56.52 
 
 
224 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  54.25 
 
 
213 aa  169  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  55.9 
 
 
224 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  52.83 
 
 
225 aa  168  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  54.67 
 
 
219 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  50.94 
 
 
218 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  53.47 
 
 
228 aa  167  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  53.06 
 
 
201 aa  167  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.28 
 
 
322 aa  167  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  51.72 
 
 
228 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  53.1 
 
 
321 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.21 
 
 
290 aa  167  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 
323 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  54.42 
 
 
220 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  55.1 
 
 
220 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  50.94 
 
 
212 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.98 
 
 
311 aa  167  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  51.27 
 
 
219 aa  167  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  51.88 
 
 
217 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  52.53 
 
 
220 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.92 
 
 
334 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.1 
 
 
321 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  51.88 
 
 
217 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  53.1 
 
 
321 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
237 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>