More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2197 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
159 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  98.74 
 
 
159 aa  332  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  97.48 
 
 
159 aa  328  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  96.86 
 
 
159 aa  327  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  96.86 
 
 
159 aa  327  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  95.6 
 
 
159 aa  323  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  93.71 
 
 
159 aa  322  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  93.71 
 
 
159 aa  322  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  93.71 
 
 
159 aa  321  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  93.71 
 
 
159 aa  321  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 
159 aa  290  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  82.91 
 
 
164 aa  285  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  79.87 
 
 
159 aa  279  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  76.73 
 
 
159 aa  269  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  76.1 
 
 
159 aa  263  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  72.96 
 
 
159 aa  254  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  71.7 
 
 
159 aa  254  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  56.77 
 
 
158 aa  180  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  54.14 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
150 aa  174  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  58.06 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 
181 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 
164 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  51.33 
 
 
225 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  52.98 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  56 
 
 
165 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 
162 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  53.55 
 
 
222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
165 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  53.69 
 
 
191 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 
182 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  52.41 
 
 
184 aa  159  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50.34 
 
 
182 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
177 aa  159  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 
208 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 
186 aa  157  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
184 aa  157  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  49.34 
 
 
223 aa  157  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  51.9 
 
 
221 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  48.65 
 
 
228 aa  156  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  49.35 
 
 
163 aa  156  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  47.74 
 
 
180 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  50.66 
 
 
220 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.03 
 
 
290 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 
178 aa  154  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  53.42 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.32 
 
 
334 aa  154  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
180 aa  154  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 
211 aa  154  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.1 
 
 
197 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.1 
 
 
183 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.59 
 
 
301 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  49.02 
 
 
220 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 
220 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 
397 aa  150  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  48.65 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
218 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  50 
 
 
229 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.03 
 
 
305 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.3 
 
 
186 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.03 
 
 
333 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.2 
 
 
300 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  50.66 
 
 
222 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.95 
 
 
186 aa  148  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 
175 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  47.68 
 
 
219 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
368 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.68 
 
 
311 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  51.35 
 
 
220 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  49.67 
 
 
213 aa  148  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  49.04 
 
 
219 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 
213 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
212 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 
153 aa  148  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.67 
 
 
181 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  48.67 
 
 
178 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 
180 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 
266 aa  147  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
225 aa  147  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  50.33 
 
 
212 aa  147  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  47.44 
 
 
353 aa  147  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 
213 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 
218 aa  146  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.98 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 
351 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 
223 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  48.03 
 
 
212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50.35 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  49.02 
 
 
220 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  49.34 
 
 
212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  52.53 
 
 
217 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.37 
 
 
212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.74 
 
 
305 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  50.34 
 
 
218 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>