More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4063 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 180 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  77.65 
 
 		 181 aa  295  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  60.57 
 
 		 184 aa  241  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  60.92 
 
 		 182 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  55.75 
 
 		 178 aa  234  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 186 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  53.93 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  53.93 
 
 		 181 aa  230  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  58.43 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  58.62 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  58.43 
 
 		 181 aa  227  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  60.23 
 
 		 183 aa  227  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  55.06 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  58.43 
 
 		 181 aa  227  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 287 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 293 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 299 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 287 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  55.06 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  55.06 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  55.49 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 182 aa  224  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  53.93 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  54.29 
 
 		 183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  53.67 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  55.49 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  55.06 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  56.9 
 
 		 277 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  54.6 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  52.57 
 
 		 182 aa  215  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  53.76 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  57.56 
 
 		 177 aa  214  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  56.73 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.96 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  51.7 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.69 
 
 		 305 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  54.97 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 		 180 aa  207  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  54.24 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  54.91 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  49.7 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50.87 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.3 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  52.35 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  50.57 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  53.45 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50.85 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  50.83 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  50.56 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 209 aa  201  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 191 aa  201  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  48.04 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.84 
 
 		 301 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  55.76 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  51.76 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 		 266 aa  197  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  52.54 
 
 		 225 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2445  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  48.33 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.42 
 
 		 309 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.69 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  49.42 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  47.16 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.29 
 
 		 300 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  47.73 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2194  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.4 
 
 		 176 aa  184  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0289  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.25 
 
 		 305 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09460  methionine-S-sulfoxide reductase  45.76 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.516558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.64 
 
 		 301 aa  177  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.05 
 
 		 301 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.09 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.51 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.09 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.05 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.45 
 
 		 301 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>