More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2304 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
301 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  73.36 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.96 
 
 
301 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.62 
 
 
301 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.62 
 
 
302 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.81 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.81 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.62 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.81 
 
 
301 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.8 
 
 
301 aa  454  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69 
 
 
301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.57 
 
 
301 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69 
 
 
300 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.23 
 
 
305 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.77 
 
 
309 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.11 
 
 
290 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.77 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.76 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.83 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.48 
 
 
333 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.52 
 
 
286 aa  275  9e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.87 
 
 
284 aa  275  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.29 
 
 
287 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.3 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.1 
 
 
306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.06 
 
 
289 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.24 
 
 
284 aa  242  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.06 
 
 
289 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.24 
 
 
284 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  55.62 
 
 
181 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 
184 aa  215  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  50.27 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  52.54 
 
 
197 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  54.24 
 
 
183 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  52.25 
 
 
182 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
186 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
186 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  47.55 
 
 
208 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  51.43 
 
 
199 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 
186 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.28 
 
 
186 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
182 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  50.56 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  50.56 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 
204 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
185 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 
180 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
185 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
185 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  50.86 
 
 
186 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  48.88 
 
 
186 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 
181 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 
181 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 
201 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 
228 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  51.45 
 
 
178 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  45.85 
 
 
211 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  50.86 
 
 
186 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  44.81 
 
 
186 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 
184 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
182 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50.86 
 
 
176 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 
228 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.55 
 
 
311 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  48.88 
 
 
277 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  47.73 
 
 
179 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.31 
 
 
181 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 
185 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  49.15 
 
 
183 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 
182 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  48.92 
 
 
198 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 
178 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
179 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  44.69 
 
 
180 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
184 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  46.55 
 
 
180 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 
190 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50.56 
 
 
182 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  47.93 
 
 
177 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.52 
 
 
178 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
191 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
179 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  48.02 
 
 
176 aa  182  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.55 
 
 
180 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  46.67 
 
 
182 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.92 
 
 
195 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 
180 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 
189 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
179 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  51.15 
 
 
177 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  48.59 
 
 
177 aa  178  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 
225 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  47.43 
 
 
179 aa  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.41 
 
 
183 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 
175 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>