More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1135 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  91.43 
 
 		 180 aa  341  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  71.35 
 
 		 181 aa  286  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  71.35 
 
 		 181 aa  286  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  74.71 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  74.14 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  71.59 
 
 		 180 aa  275  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  70.69 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  67.24 
 
 		 178 aa  250  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 186 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  64 
 
 		 182 aa  235  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  60.23 
 
 		 199 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  60.23 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  60.23 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 182 aa  234  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  61.71 
 
 		 182 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  59.66 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  59.09 
 
 		 186 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  59.09 
 
 		 186 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  63.53 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 184 aa  225  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  58.05 
 
 		 178 aa  224  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  56.18 
 
 		 181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 		 277 aa  224  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 287 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  58.86 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 180 aa  220  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  55.06 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  57.89 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  55.43 
 
 		 197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  55.62 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  57.31 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  55.87 
 
 		 186 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  55.31 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  54.49 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  52.87 
 
 		 190 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  56.89 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  55.31 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  52.66 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52 
 
 		 184 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.89 
 
 		 266 aa  201  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  54.02 
 
 		 175 aa  198  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  55.9 
 
 		 225 aa  195  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  57.23 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50.87 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.43 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  54.39 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50.88 
 
 		 182 aa  191  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  49.15 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.86 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  47.16 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.59 
 
 		 305 aa  185  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.02 
 
 		 301 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  52.69 
 
 		 165 aa  184  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  51.12 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.37 
 
 		 301 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  51.45 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.88 
 
 		 309 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.7 
 
 		 301 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  47.73 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.1 
 
 		 301 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.1 
 
 		 301 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0740  methionine sulfoxide reductase A  51.5 
 
 		 165 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0698569  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  48.86 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 		 216 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  47.7 
 
 		 359 aa  178  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1362  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.526795  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0786  methionine sulfoxide reductase A  50.3 
 
 		 168 aa  177  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 		 173 aa  177  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  47.67 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 		 211 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 		 204 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.25 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.31 
 
 		 301 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0289  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>