More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0786 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0786  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 168 aa  347  6e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  62.11 
 
 		 165 aa  223  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1362  methionine sulfoxide reductase A  62.11 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.526795  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0740  methionine sulfoxide reductase A  62.73 
 
 		 165 aa  221  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0698569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 228 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.27 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.34 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50.62 
 
 		 208 aa  164  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  48.19 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.27 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  43.64 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.58 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  43.64 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  46.63 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.85 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.62 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  44.72 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  45.12 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  44.79 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.8 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  45.24 
 
 		 182 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.24 
 
 		 180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  42.26 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2194  peptide methionine sulfoxide reductase  43.83 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 180 aa  153  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  43.45 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  41.61 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  43.83 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  45.96 
 
 		 266 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  43.83 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  43.83 
 
 		 199 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  46.01 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  46.01 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.06 
 
 		 183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  44.79 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2445  peptide methionine sulfoxide reductase  43.83 
 
 		 174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09460  methionine-S-sulfoxide reductase  41.1 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  42.17 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 277 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  40.62 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  43.21 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  41.61 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.61 
 
 		 305 aa  148  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 209 aa  148  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 299 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 		 204 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 293 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  42.86 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 287 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 287 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  41.82 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  40.37 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0289  peptide methionine sulfoxide reductase  45.12 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.61 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  41.32 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  41.61 
 
 		 182 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  40.74 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  41.57 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 301 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.42 
 
 		 301 aa  141  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.24 
 
 		 301 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.24 
 
 		 301 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  40.99 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.12 
 
 		 301 aa  140  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  41.18 
 
 		 181 aa  140  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.24 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  40.48 
 
 		 179 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  40.36 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  41.04 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  41.21 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.12 
 
 		 301 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  38.55 
 
 		 262 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  51.75 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  44.31 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.32 
 
 		 309 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  40.99 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.12 
 
 		 302 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1027  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.143691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>