More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1027 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1027  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 164 aa  342  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.143691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  80.86 
 
 		 178 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  75.93 
 
 		 176 aa  261  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 183 aa  191  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  54.32 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  52.47 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 		 266 aa  189  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  53.7 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 228 aa  186  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  53.8 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  52.15 
 
 		 181 aa  185  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  52.9 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  51.88 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  54.66 
 
 		 185 aa  181  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  53.21 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  54.84 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.61 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  53.7 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50.97 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  51.92 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  51.55 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.25 
 
 		 305 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  55.13 
 
 		 299 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 		 287 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 		 293 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  55.13 
 
 		 287 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 182 aa  174  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 209 aa  174  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 		 183 aa  173  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.91 
 
 		 184 aa  173  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  49.07 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  52.44 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  52.2 
 
 		 195 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  53.8 
 
 		 191 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 		 208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  48.45 
 
 		 181 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  48.15 
 
 		 182 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  50.97 
 
 		 182 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 		 277 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  45.12 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 225 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  49.08 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  51.55 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 		 228 aa  167  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  49.69 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  48.77 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 309 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.2 
 
 		 301 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.2 
 
 		 301 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  47.24 
 
 		 180 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.2 
 
 		 301 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.68 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  46.75 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.91 
 
 		 301 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  54.84 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  46.54 
 
 		 175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.96 
 
 		 301 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 		 204 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  49.38 
 
 		 184 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.68 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.3 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.3 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.06 
 
 		 301 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.3 
 
 		 302 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0289  peptide methionine sulfoxide reductase  50.31 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  48.41 
 
 		 220 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2194  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 		 174 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 216 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.06 
 
 		 301 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2445  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.79 
 
 		 305 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.01 
 
 		 301 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  47.1 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>