More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0289 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0289  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
175 aa  367  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  77.14 
 
 
173 aa  288  3e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  75.72 
 
 
173 aa  279  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2194  peptide methionine sulfoxide reductase  53.45 
 
 
174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2445  peptide methionine sulfoxide reductase  52.87 
 
 
174 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  53.45 
 
 
176 aa  192  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  51.14 
 
 
197 aa  189  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  55.81 
 
 
177 aa  188  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  52.51 
 
 
181 aa  188  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  51.96 
 
 
181 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  51.15 
 
 
186 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 
178 aa  185  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
184 aa  185  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  51.76 
 
 
178 aa  184  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  51.15 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50.89 
 
 
186 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 
184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  50.89 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 
209 aa  180  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 
183 aa  180  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  51.14 
 
 
186 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 
186 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  50.28 
 
 
191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09460  methionine-S-sulfoxide reductase  45.66 
 
 
193 aa  177  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  51.98 
 
 
186 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  51.98 
 
 
186 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  51.98 
 
 
186 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 
182 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
199 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.12 
 
 
184 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 
180 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
208 aa  175  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
201 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
183 aa  175  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  48.86 
 
 
177 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  47.73 
 
 
178 aa  175  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 
179 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  47.16 
 
 
175 aa  174  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.52 
 
 
182 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
177 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.32 
 
 
180 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  49.44 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  45.2 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  52.83 
 
 
228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.29 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.89 
 
 
178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.98 
 
 
301 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  47.9 
 
 
197 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  52.33 
 
 
178 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
180 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  47.43 
 
 
277 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
180 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.63 
 
 
180 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.59 
 
 
305 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
293 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  48 
 
 
287 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  50.6 
 
 
179 aa  169  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  48 
 
 
299 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
287 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 
182 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
266 aa  168  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  49.13 
 
 
183 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 
182 aa  167  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.71 
 
 
176 aa  167  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  48.19 
 
 
175 aa  167  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  45.09 
 
 
182 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  44.38 
 
 
180 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 
185 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 
186 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  49.42 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  49.1 
 
 
184 aa  164  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  45.24 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.42 
 
 
301 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.42 
 
 
301 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  44.19 
 
 
198 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 
211 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.84 
 
 
301 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 
216 aa  160  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1362  methionine sulfoxide reductase A  45.24 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.526795  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0740  methionine sulfoxide reductase A  45.83 
 
 
165 aa  160  9e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0698569  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  45.24 
 
 
165 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.88 
 
 
309 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 
301 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.62 
 
 
301 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  46.3 
 
 
225 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 
301 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.7 
 
 
301 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1027  peptide methionine sulfoxide reductase  50.31 
 
 
164 aa  158  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.143691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>