More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2559 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  57.67 
 
 		 236 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  55.84 
 
 		 216 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  55.61 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  54.55 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  56.15 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  55.03 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  51.69 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  54.12 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  53.06 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 245 aa  208  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  52.82 
 
 		 246 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  50.5 
 
 		 242 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  51.81 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  53.89 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  49.22 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  49.74 
 
 		 243 aa  201  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  48.96 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  53.45 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  49.74 
 
 		 246 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  49.74 
 
 		 246 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  51.04 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.03 
 
 		 301 aa  197  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  51.83 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  50.86 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 		 266 aa  195  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  49.22 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.04 
 
 		 301 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.85 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  51.3 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  51.3 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.54 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  50.78 
 
 		 247 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  52.02 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 182 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  52.43 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.83 
 
 		 301 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  52.57 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  51.38 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.69 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  49.15 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.27 
 
 		 301 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 178 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 181 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  51.53 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.9 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.04 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  49.43 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.5 
 
 		 302 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  50.27 
 
 		 238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  50.89 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  47.5 
 
 		 245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.05 
 
 		 301 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 		 182 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.05 
 
 		 301 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  47.19 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  40.29 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 183 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 277 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 293 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.35 
 
 		 309 aa  177  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  48.86 
 
 		 234 aa  177  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  50.89 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  48.8 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  47.46 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.35 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>