More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2748 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  68.8 
 
 		 239 aa  330  9e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  55.5 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  56.31 
 
 		 246 aa  238  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  54.84 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  54.85 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  49.55 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  55.88 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  49.58 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  55.5 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  55.5 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  54.92 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  48.94 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  55.5 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  56.91 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  56.91 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  56.91 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  58.7 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  52.91 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  54.11 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  55.45 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  53.27 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  52.97 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  54.08 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  53.61 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  52.48 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  54.64 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  54.59 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  51.11 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  49.48 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  45.66 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  45.21 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  50.5 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  48.29 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  47 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  47 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  36.48 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  44.71 
 
 		 199 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.31 
 
 		 301 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  41.53 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  39.01 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.76 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.02 
 
 		 301 aa  154  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 165 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  41.38 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 		 183 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  40.83 
 
 		 180 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.2 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 301 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 179 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  48.63 
 
 		 158 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 302 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  34.86 
 
 		 416 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  42.26 
 
 		 182 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.61 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  41.11 
 
 		 184 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  47.95 
 
 		 158 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  43.64 
 
 		 178 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  38.15 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  45.18 
 
 		 176 aa  148  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  45.29 
 
 		 191 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  41.38 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 		 177 aa  148  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  41.95 
 
 		 176 aa  148  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  42.6 
 
 		 197 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  43.33 
 
 		 186 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 211 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.3 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  43.2 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.59 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  39.41 
 
 		 177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.17 
 
 		 184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  40.7 
 
 		 178 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 182 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>