More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1762 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 240 aa  486  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  97.92 
 
 		 240 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  88.75 
 
 		 238 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  72.77 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  57.33 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  59.5 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  60.59 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  59.71 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  57.56 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 236 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  53.09 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  57.27 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  59.49 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  56.6 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  56.37 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  57.21 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  51.34 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  54.87 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  54.9 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  57.78 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  52.45 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  55.38 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  55.38 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  54.87 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  52.7 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  58.1 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  59.41 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  59.41 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  53.3 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  48.18 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  46.32 
 
 		 243 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  51.47 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  54.07 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  52.05 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  47.87 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  45.25 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 		 301 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.65 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.81 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.81 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.3 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.06 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.21 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 178 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.66 
 
 		 301 aa  165  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50.58 
 
 		 176 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.33 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.62 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  44.02 
 
 		 184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  41.94 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.47 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.09 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  42.61 
 
 		 201 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.24 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.07 
 
 		 184 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.15 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.18 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 185 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 		 183 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.89 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  42.53 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  45.05 
 
 		 186 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.42 
 
 		 338 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  43.65 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.94 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.79 
 
 		 290 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  41.11 
 
 		 180 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.94 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 186 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  42.61 
 
 		 180 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 186 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  42.03 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  44.51 
 
 		 175 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  45.14 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.62 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  43.43 
 
 		 180 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  49.44 
 
 		 178 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44.57 
 
 		 180 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  40.91 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>