More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6719 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
247 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  98.38 
 
 
247 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  98.38 
 
 
247 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  92.44 
 
 
247 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  88.16 
 
 
246 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  87.76 
 
 
246 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  86.22 
 
 
247 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  64.73 
 
 
246 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  69.52 
 
 
245 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  63.27 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  57.26 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  59.65 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  59.53 
 
 
235 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  58.94 
 
 
234 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  55.7 
 
 
235 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  52.74 
 
 
249 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  57.01 
 
 
246 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  54.7 
 
 
242 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  57.21 
 
 
236 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  59.9 
 
 
233 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  56.67 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  57.21 
 
 
236 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  54.87 
 
 
245 aa  244  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  56.22 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  61.45 
 
 
245 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  56.57 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  63.07 
 
 
225 aa  232  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  52.25 
 
 
229 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  58.03 
 
 
238 aa  225  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  52.51 
 
 
239 aa  222  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  57.38 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  58.1 
 
 
240 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  57.54 
 
 
240 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  55.78 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  49.55 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  56 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 
262 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  50.78 
 
 
211 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  50.78 
 
 
198 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  53.07 
 
 
216 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.99 
 
 
301 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.03 
 
 
301 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
180 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.56 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.99 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  34.15 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.56 
 
 
301 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.82 
 
 
197 aa  171  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  48.57 
 
 
180 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
176 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  43.27 
 
 
210 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.99 
 
 
301 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.99 
 
 
301 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.99 
 
 
301 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.71 
 
 
301 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 
178 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 
183 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  48.82 
 
 
228 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  47.67 
 
 
178 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
177 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  45.71 
 
 
180 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  46.63 
 
 
220 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 
184 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 
204 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.89 
 
 
301 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.06 
 
 
290 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  46.01 
 
 
201 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 
178 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.58 
 
 
301 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.65 
 
 
228 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
182 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.46 
 
 
178 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 
182 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  43.33 
 
 
186 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
189 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.46 
 
 
184 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
186 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 
177 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  48.63 
 
 
195 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.39 
 
 
300 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 
179 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
181 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
181 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
178 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 
180 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  46.82 
 
 
175 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 
185 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.5 
 
 
181 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
182 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  43.58 
 
 
209 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
191 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 
190 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 
181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 
179 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.71 
 
 
338 aa  155  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
183 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  43.58 
 
 
180 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  47.09 
 
 
277 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 
177 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>