More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2632 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  61 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  55.36 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  59.18 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  60.42 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  60.2 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  53.39 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  57.29 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  54.22 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  57.92 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 		 235 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  56.44 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  56.72 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  57.51 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  59.59 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 229 aa  237  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  57.87 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  55.61 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  53.88 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  57.36 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  63.07 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  60.8 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  56.48 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  62.5 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  62.5 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  57.87 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  53.69 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  55.03 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  59.54 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  50.45 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  50.71 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  54.12 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  58.19 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  55.21 
 
 		 240 aa  208  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  53.4 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  55.32 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 178 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  51.09 
 
 		 197 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  49.42 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  48.52 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 181 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 178 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 		 183 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  45.14 
 
 		 180 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 177 aa  175  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  43.72 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 		 180 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  41.38 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.89 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  45.29 
 
 		 180 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 182 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  40.29 
 
 		 266 aa  171  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 184 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  46.75 
 
 		 178 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.95 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.21 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.47 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.83 
 
 		 287 aa  168  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.64 
 
 		 177 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  44.64 
 
 		 180 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  44.83 
 
 		 180 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  46.51 
 
 		 175 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.05 
 
 		 186 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 180 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44 
 
 		 181 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  43.02 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  47.98 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.35 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44.77 
 
 		 180 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.59 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.08 
 
 		 301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  47.67 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.08 
 
 		 301 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.05 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 179 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>