More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3834 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  81.82 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  82.13 
 
 		 236 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  77.14 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  74.18 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  72.3 
 
 		 236 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  66.19 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  61.34 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  60.09 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  58.3 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  64.82 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  59.53 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  59.07 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  59.07 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  62.32 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  56.94 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  56.74 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  56.48 
 
 		 246 aa  254  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  59.8 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  57.49 
 
 		 247 aa  247  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  53.95 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 		 245 aa  244  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  52.81 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  56.46 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  58.95 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  58.46 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  57.44 
 
 		 240 aa  237  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  55.45 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  56.68 
 
 		 262 aa  222  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  57.14 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  49.77 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  51.27 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  47.47 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.76 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.85 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.31 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  41.98 
 
 		 197 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50.58 
 
 		 176 aa  178  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  40.38 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.32 
 
 		 305 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.41 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  47.46 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.41 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.89 
 
 		 208 aa  175  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 181 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 180 aa  174  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 		 182 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  45.2 
 
 		 178 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  45.3 
 
 		 186 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.09 
 
 		 182 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  50.81 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 185 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  51.69 
 
 		 186 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 		 177 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.93 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 179 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.21 
 
 		 290 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  48 
 
 		 180 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  45 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 179 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  49.07 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  46.07 
 
 		 182 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 182 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.98 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  45.14 
 
 		 180 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  46.11 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.89 
 
 		 180 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.5 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.63 
 
 		 184 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  46.29 
 
 		 180 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  46.37 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 		 175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.53 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.21 
 
 		 338 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.86 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 177 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 		 175 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  48.52 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>