More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1873 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
246 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  70.12 
 
 
238 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  72.77 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  73.3 
 
 
240 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  57.81 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  57.53 
 
 
225 aa  249  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  59.22 
 
 
236 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  53.78 
 
 
248 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  60.87 
 
 
238 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  60.58 
 
 
233 aa  244  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  54.85 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
246 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  59.14 
 
 
235 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  54.95 
 
 
234 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  49.59 
 
 
243 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  55.1 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  55.45 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  55.24 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  56.28 
 
 
246 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
245 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  54.41 
 
 
246 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  52.54 
 
 
245 aa  224  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  58.7 
 
 
234 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  55.61 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  54.35 
 
 
240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  56 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  56 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  56 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  57.54 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  53.66 
 
 
247 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  56.98 
 
 
246 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  49.08 
 
 
229 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
245 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  58.19 
 
 
225 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  57.54 
 
 
247 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  44.35 
 
 
243 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  54.46 
 
 
229 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  49.05 
 
 
262 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  52.43 
 
 
211 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  52.43 
 
 
198 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
216 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.68 
 
 
301 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.74 
 
 
301 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.68 
 
 
302 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  43.98 
 
 
209 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.68 
 
 
301 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.68 
 
 
301 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.29 
 
 
290 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  47.73 
 
 
176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  44.07 
 
 
180 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.88 
 
 
334 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.6 
 
 
301 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 
180 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.07 
 
 
301 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  41.52 
 
 
266 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.07 
 
 
301 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 
190 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.61 
 
 
301 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.55 
 
 
284 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 
178 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  43.82 
 
 
186 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
184 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.96 
 
 
305 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
184 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44 
 
 
180 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.14 
 
 
197 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 
210 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 
220 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  43.1 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.67 
 
 
287 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  43.68 
 
 
177 aa  154  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  42.22 
 
 
186 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  43.43 
 
 
178 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.12 
 
 
301 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.17 
 
 
228 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 
184 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 
179 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 
225 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
182 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.32 
 
 
351 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  43.93 
 
 
182 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  45.66 
 
 
175 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.67 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  41.24 
 
 
186 aa  151  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  41.04 
 
 
179 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 
186 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
185 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
185 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
185 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.56 
 
 
338 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  46.24 
 
 
299 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.92 
 
 
305 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
287 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  45.2 
 
 
195 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  40.7 
 
 
180 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>