More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0817 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  90.65 
 
 
246 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  80.19 
 
 
245 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  68.12 
 
 
243 aa  337  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  67.73 
 
 
248 aa  318  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  64.73 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  71.01 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  71.01 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  64.1 
 
 
247 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  68.6 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  68.6 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  70.05 
 
 
247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  64.39 
 
 
234 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  65.82 
 
 
235 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  56.9 
 
 
249 aa  281  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
246 aa  268  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  55.36 
 
 
242 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  58.25 
 
 
236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  57.56 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  57.49 
 
 
240 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  57 
 
 
236 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  57.77 
 
 
235 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 
245 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  58.29 
 
 
225 aa  244  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  56.7 
 
 
243 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  55.88 
 
 
236 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  58.13 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  56.76 
 
 
229 aa  241  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  51.69 
 
 
238 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  55.45 
 
 
239 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  50.83 
 
 
245 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  58.33 
 
 
240 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  57.78 
 
 
240 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  54.63 
 
 
246 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  50.46 
 
 
225 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  53.27 
 
 
229 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  52.31 
 
 
198 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  52.31 
 
 
211 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  49.74 
 
 
262 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  49 
 
 
216 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.63 
 
 
301 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.09 
 
 
301 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.54 
 
 
301 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.71 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  43.59 
 
 
209 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  43.39 
 
 
197 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.28 
 
 
301 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 
266 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.59 
 
 
301 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
190 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.79 
 
 
301 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.79 
 
 
301 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.87 
 
 
301 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.79 
 
 
302 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  47.16 
 
 
180 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.02 
 
 
228 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  46.89 
 
 
201 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.06 
 
 
210 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  40.19 
 
 
228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.89 
 
 
180 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  44.32 
 
 
176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  41.99 
 
 
186 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.5 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
186 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  45.14 
 
 
180 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
179 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.78 
 
 
184 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  42.7 
 
 
182 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
179 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
186 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
186 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  46.2 
 
 
199 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 
185 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 
181 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.37 
 
 
290 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  45.3 
 
 
186 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  42.37 
 
 
219 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
186 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  46.7 
 
 
177 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
186 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
183 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  44.89 
 
 
178 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
181 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
186 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  45.71 
 
 
186 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
181 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  44.07 
 
 
204 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  41.81 
 
 
208 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 
180 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.2 
 
 
305 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 
182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 
184 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 
183 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
182 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 
185 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 
185 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>