More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2741 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  63.68 
 
 
235 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  64.79 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  64.79 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  59.57 
 
 
248 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  64.79 
 
 
236 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  65.88 
 
 
238 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  61.68 
 
 
234 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  64.59 
 
 
236 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  59.92 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  61.54 
 
 
235 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  60.66 
 
 
245 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  56.94 
 
 
246 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  59.05 
 
 
243 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  56.02 
 
 
246 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  59.91 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  57.29 
 
 
225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  55.79 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  61.75 
 
 
247 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.11 
 
 
229 aa  244  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  61.75 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  61.75 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  54.3 
 
 
247 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
243 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  58.1 
 
 
240 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  57.71 
 
 
246 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  56.94 
 
 
240 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  55.12 
 
 
247 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  55.71 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  53.81 
 
 
246 aa  232  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  48.89 
 
 
239 aa  225  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  56.91 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
216 aa  215  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  52.15 
 
 
225 aa  214  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  50.5 
 
 
198 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  50.5 
 
 
211 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
262 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  49.26 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
220 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  41.99 
 
 
266 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
184 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
210 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.15 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.11 
 
 
178 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.29 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  47.59 
 
 
197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
182 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.39 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.31 
 
 
301 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  50.3 
 
 
180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.31 
 
 
302 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.75 
 
 
301 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.75 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50.58 
 
 
176 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
201 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.81 
 
 
301 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 
185 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 
180 aa  175  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.59 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.7 
 
 
181 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  52.07 
 
 
184 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.8 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.79 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.44 
 
 
338 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.71 
 
 
186 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.4 
 
 
176 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 
183 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 
182 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.88 
 
 
183 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.37 
 
 
208 aa  168  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  43.39 
 
 
180 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1656  peptide methionine sulfoxide reductase  39.82 
 
 
225 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  45.83 
 
 
186 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  45.93 
 
 
175 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
178 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.94 
 
 
333 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  45.14 
 
 
179 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  43.32 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  47.24 
 
 
181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  47.24 
 
 
181 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  44.85 
 
 
180 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  44.64 
 
 
186 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.82 
 
 
181 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.54 
 
 
334 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.24 
 
 
177 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
175 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  49.1 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.5 
 
 
305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.44 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  45.24 
 
 
179 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 
179 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.02 
 
 
351 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>