More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1371 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
334 aa  701    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  73.08 
 
 
333 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  74.59 
 
 
338 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  74.3 
 
 
284 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  73.52 
 
 
287 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  72.22 
 
 
290 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65 
 
 
334 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.54 
 
 
286 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.07 
 
 
351 aa  342  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.3 
 
 
306 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.74 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.63 
 
 
289 aa  319  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.38 
 
 
284 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.27 
 
 
289 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.33 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.98 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.98 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.98 
 
 
301 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
305 aa  298  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.06 
 
 
301 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
301 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.35 
 
 
301 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
302 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
301 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
300 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.55 
 
 
309 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.31 
 
 
305 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.59 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.76 
 
 
301 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.14 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.19 
 
 
322 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  59.12 
 
 
173 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
209 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  53.9 
 
 
178 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  54.66 
 
 
169 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 
180 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.56 
 
 
208 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  50.32 
 
 
197 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  50.63 
 
 
182 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.43 
 
 
201 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
155 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  54.61 
 
 
184 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  51.95 
 
 
176 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
266 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  63.64 
 
 
159 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 
158 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
183 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  47.85 
 
 
249 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.9 
 
 
176 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.98 
 
 
262 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
186 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  50.97 
 
 
175 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 
186 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 
186 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
242 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  49.35 
 
 
185 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
199 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 
178 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
184 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  66.39 
 
 
124 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  50.63 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
150 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  53.02 
 
 
163 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  55.35 
 
 
225 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  51.97 
 
 
178 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
180 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46.41 
 
 
186 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
186 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 
180 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  57.24 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  57.93 
 
 
240 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
182 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
183 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  50.32 
 
 
158 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.86 
 
 
186 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
228 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  51.88 
 
 
246 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 
182 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  54.61 
 
 
238 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
177 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 
212 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 
177 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
178 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
181 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
182 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  51.92 
 
 
235 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.71 
 
 
180 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.59 
 
 
184 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
183 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  54.9 
 
 
225 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  49.04 
 
 
179 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
182 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
184 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 
165 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  47.77 
 
 
190 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  51.52 
 
 
216 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>